球速体育平台-球速(中国)




    1. 欢(huān)迎访问合肥中(zhōng)科金臻生物医学有限公司官(guān)网! 加入收藏 |联系我们
      球速体育平台-球速(中国)
      locations: 首页 - 新闻中心(xīn) - 公司(sī)新闻

      5hmC或成为2型糖(táng)尿病血管并发症(zhèng)临床监(jiān)控的(de)重要标志物(wù)

      source:TIME:2019-10-01 08:00:00分享到(dào):

      2019年(nián)10月1日,5-羟甲基化胞(bāo)嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)在糖(táng)尿病(bìng)研究领域取得重要进展(zhǎn)。2型糖尿病(T2D)的(de)血(xuè)管(guǎn)并发(fā)症是导致2型糖尿病(bìng)致残致(zhì)死的重要(yào)病因,一(yī)直缺乏一种(zhǒng)无创便捷的临(lín)床途径实现血管(guǎn)并发症的发(fā)生(shēng)发展(zhǎn)监测,达到早发现、早干预,以提高T2D病人(rén)的整体生活(huó)质量,减少卫生经济负担。


      该(gāi)研究入组了62例2型糖尿(niào)病病人,采用5hmC-Seal技术对(duì)血浆cfDNA中(zhōng)表观遗传标志物5hmC的分布情况进行检测,分析5hmC标志物与2型(xíng)糖尿(niào)病血管并发症(zhèng)发生发展的相(xiàng)关性。结果表(biǎo)明(míng)5hmC标志物的变化与T2D合并大血管/微(wēi)血管事件具有(yǒu)相关性,主要(yào)涉及一些与血管生物学和糖尿(niào)病(包括胰岛素耐(nài)受和(hé)炎症反(fǎn)应)相(xiàng)关(guān)的基因和信(xìn)号通路。该(gāi)研究建(jiàn)立的(de)16个基因-5hmC标志物组合检测可(kě)以准确区分(fèn)有(yǒu)并发症和无并发症的2型糖尿(niào)病病人[实验组:AUC=0.85;95% CI,0.73-0.96],明显优于传统临床变量例如白蛋白尿。除此之外(wài),还建立了13个(gè)基因-5hmC标志物组合检(jiǎn)测,可(kě)以进一步区分(fèn)T2D合并单一并发症和(hé)多种并(bìng)发症(zhèng)[实验组:AUC=0.84;95% CI,0.68-0.99],同样明显优于(yú)其他传(chuán)统临(lín)床变量。该研(yán)究得出结论,5hmC标志(zhì)物反映了T2D病人大血管/微(wēi)血管并发(fā)症发生过程中的表观遗传变化,因(yīn)而5hmC-Seal检(jiǎn)测技术在监测糖尿(niào)病血管并发症发生和进展方(fāng)面具有良好的临床应用前(qián)景。


      试验设(shè)计



      本研究共纳(nà)入62例2型糖尿病(bìng)病人(rén),包括没有血(xuè)管(guǎn)并(bìng)发症(zhèng)的病人(rén)12例,有单一血管(guǎn)并发症的病人34例(24例发生大(dà)血管事件,10例(lì)发生微血管事件),以及有多种血管并发症的病人16例。试(shì)验收集62例病人血(xuè)浆(jiāng),提取cfDNA,利(lì)用5hmC-Seal技术捕获(huò)外周血cfDNA中的5hmC序列,进行(háng)二代测序,通(tōng)过生物信息学分析找(zhǎo)出(chū)并(bìng)发症组与无并发症(zhèng)组之间有显著5hmC修(xiū)饰差异的(de)基(jī)因,单(dān)一(yī)并发症组和多种并发症组之(zhī)间有显著(zhe)5hmC修饰差异的(de)基因。随后利用回归模型对差异基因进一步筛选、优化,弹性网络进一步(bù)筛选,计算(suàn)加(jiā)权(quán)平(píng)均分,最后(hòu)得到一组具有高度灵敏(mǐn)度(dù)和特异(yì)性的5hmC生物标记物,并进一步在实(shí)验组(zǔ)中验证,分析其灵敏度和特异性。并将新建(jiàn)立(lì)的(de)5hmC标志(zhì)物基因组合的检测性能(néng)与(yǔ)传统(tǒng)临床变(biàn)量进行对比分析。最后对相关(guān)基(jī)因(yīn)进行了信号通路分析和功能(néng)探究。



      研究结果


      5hmC修饰水平与血(xuè)管并发症具(jù)有相关性


      利用逻辑回归模(mó)型(xíng)对62例(lì)有并发症和无并发症2型糖尿病病人的5hmC差异(yì)水平(píng)进(jìn)行分析(xī)发现,有并发症2型(xíng)糖(táng)尿(niào)病病人的622个差异修(xiū)饰候选基(jī)因(包括上调和下(xià)调(diào)基(jī)因)的(de)归一化平均数要明显高于无并发症的病人(P<0.001),但是单(dān)一并发症和多发(fā)并(bìng)发症病人之间(jiān)没有显著差异。

      之后将有(yǒu)单一并发症(zhèng)或多种并发症的50例病人用逻辑回(huí)归模型进行了对比,发现多种并发症的病人的153个差(chà)异修饰(shì)候选基(jī)因(包(bāo)括上调和下调基(jī)因)的归一化平均(jun1)数要低于无并发症病人(rén)(P<0.001)。


      5hmC标志(zhì)物可区分(fèn)有无并发症(zhèng)患者


      62例2型糖尿病病人被随机(jī)分(fèn)成(chéng)训练组(n=31)和测试组(n=31)。利用弹性网络筛选后(hòu)发(fā)现,16基因-5hmC标(biāo)志物组合(hé)检测(cè)可以用(yòng)于区分有并发症和无(wú)并(bìng)发症的2型(xíng)糖尿病病人。


      基于16基(jī)因组合模型 (Detection Model 1) 的加(jiā)权(quán)平均分分析,发现无并发症病(bìng)人的分数在训练集和测(cè)试集中都明(míng)显低于有并(bìng)发症的病人。只考虑加(jiā)权平均分的话,受试(shì)者工作特征(zhēng)曲线(xiàn)(ROC)分析(xī)表明将cutoff值设(shè)置成0.5时,在测试(shì)组中(zhōng)中的灵敏度为60%,特(tè)异(yì)性为100%。



      5hmC标(biāo)志物可区(qū)分病人是单一并发(fā)症还是(shì)多种并发症


      50例有并发症的2型糖尿病病人被随机分成训练(liàn)组(n=25)和测试组(n=25)。利用弹性网络筛选后发现,13基因-5hmC标志物组合可以区分(fèn)2型糖尿病(bìng)病人是否(fǒu)发(fā)生单一(yī)并发症或多(duō)种并发症(zhèng)。


      基于13基因组合模型 (Detection Model 2), 我们(men)计算(suàn)了单一(yī)并发症(zhèng)和多种并发(fā)症的加权平均(jun1)分,发现在训练集和测试(shì)集中(zhōng)单(dān)一并发症和多种并发症病人的分数都(dōu)有明(míng)显差异。值(zhí)得一提的是,有肾病并发症和无肾病并发症病人(rén)的分数也有明显差异。利用加(jiā)权(quán)平均(jun1)分作为判断(duàn)标准的受试者工作特征曲线(ROC)表明,在测(cè)试组中当将cutoff值设成(chéng)0.69时,灵敏度为87.5%,特异性为68.8%。



      5hmC标志物与传统(tǒng)临床变(biàn)量/危险(xiǎn)因子的(de)对比


      我们评(píng)估了不同临床变量/危险因子用于监测血(xuè)管并(bìng)发(fā)症的灵敏度和特(tè)异性(见表1)。

      总体来说,结果表(biǎo)明(míng)一些临床变量(如(rú)尿液白(bái)蛋白、血清(qīng)ALT、AST、肌酐、GGT、脂蛋白(bái)a)虽然具有一定(dìng)的(de)灵敏度和特异性(xìng),但是整体准(zhǔn)确度仍然差强人意,因(yīn)此临床需要(yào)更加准确的方(fāng)法。另外,我们还在训(xùn)练(liàn)组中建立5hmC和不同临(lín)床变量的多变量组合模型进行评估,该模型(xíng)加(jiā)权平均分的AUC要明显大于传统临床变量的AUC。若(ruò)将这些(xiē)临(lín)床变(biàn)量(liàng)与加权平均分进行结合,AUC也将进一步提高。因此,该多变量模型表(biǎo)明加权平均分(fèn)可(kě)作为一个独立的指标用于监测2型糖尿病血管并发症。

      信(xìn)号通路分析和功(gōng)能探究


      有并发症(zhèng)和无并(bìng)发症(zhèng)病人的135个差异候选基因的功能(néng)注释(shì)分析表明,这(zhè)些基因主要富集在一些(xiē)经典的信(xìn)号通路。错(cuò)误(wù)发现率相关(guān)P值位于前10%和基因数目≥3的信号通路包括由IGF1R, IL-10和FGFR2所(suǒ)介(jiè)导的信号(hào)通路。由IGF1R和IL-10介导的信号通路与胰岛素(sù)抵抗及炎症反应相关(guān),在血管生物学(xué)和糖尿病发(fā)生发展(zhǎn)过程中(zhōng)发挥(huī)重(chóng)要(yào)作用。

      Reactome相互作用网络的中(zhōng)心表明,泛素(sù)编码基因[泛素B (UBB),泛素C (UBC),泛(fàn)素A-52亚基核糖体蛋白融合产物1(UBA52)]是候选(xuǎn)基因(如(rú)SMAD3FOXD2DRAP1MCIDASMLNPIANPTBCC)的(de)重要连接(jiē)者。在这135个差异候选(xuǎn)基因中, 一些基因 (如TNFRSF25P=0.027, HR=6.25; MLNP=0.0021, HR=20.40; CCL3L1P=0.018, HR=0.44)表现(xiàn)出与(yǔ)糖尿病病(bìng)程相关的倾向,表明(míng)5hmC和糖尿病血(xuè)管并发症之(zhī)间可能(néng)存在时间依赖性的相互作用。基于纵向时间队列的(de)大样本研(yán)究(jiū),将可进(jìn)一步明确5hmC变化(huà)和糖尿病持续时间之间的动态关联。关于单一并发症和多种并发症病(bìng)人的159个候选(xuǎn)标志基(jī)因的功能注(zhù)释研究发(fā)现,存在细胞-细胞(bāo)连接、胶(jiāo)原蛋白形(xíng)成(chéng)、新(xīn)陈代谢(xiè)、细胞应激应(yīng)答信号通路的富集,这些信号通路均与细胞基本功能密切相关。


      研究意义



      血管并发症是三分之(zhī)二糖尿病病(bìng)人的死亡原因(yīn),若能及早(zǎo)有效控制血管并发症的发生,将极大地改善糖尿病病人的生存质量。该研究建立了一种利用cfDNA进行(háng)2型糖尿病血管并(bìng)发(fā)症监测(cè)的(de)无创便(biàn)捷(jié)方法,较(jiào)目前临床标志物能(néng)更(gèng)准确地(dì)监控血管(guǎn)并发症的发生(shēng),从(cóng)而提示临床及早采取应对措施(shī),有效控制病(bìng)情进展(zhǎn)。



      合肥球速体育平台和中科金臻生物医学有限公司 版权所有(yǒu) 皖ICP备16021320号-1 Designed by Wanhu

      球速体育平台-球速(中国)

      球速体育平台-球速(中国)